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二穗短柄草抗病基因家族的分析及机器学习预测方法研究
ISBN：978-7-5689-2181-7
作者：谭生龙 陈利红
编辑：杨粮菊 涂昀
字数(千)：265 页数：158 印次：1-1
开本：16开  平装
出版时间： 2020-08-13
定价：¥68

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内容简介

抗病基因对植物的生长发育起着非常重要的免疫调控作用，植物中抗病基因的数量和特征对该植物的抗病机制研究至关重要。本书选择禾本科植物二穗短柄草作为研究对象，系统鉴定了该物种内最重要的一类抗病基因家族，这类抗病基因所编码的蛋白具有核苷酸结合结构域（NBS, Nucleotide Binding Site）和亮氨酸重复结构域（LRR, Leucine-Rich Repeats），并系统分析了这些抗病基因。在获得二穗短柄草中的NBS-LRR抗病基因列表后，继续研究了其数字序列特征，并应用机器学习中的支持向量机算法对这些特征进行训练建模，构建和优化后的机器学习模型，可实现对其他已测序物种的快速抗病基因鉴定。本书可供基因分析及机器预测学习方法研究人员参考。

目录
1绪论
1.1植物抗病基因概述
1.2植物抗病基因研究中的生物信息学
1.3常用生物信息学数据库和分析软件
1.4本书的技术线路图
1.5本书的主要内容
1.6本书的目的和意义
2二穗短柄草抗病基因家族NBS-LRR的鉴定与生物信息学分析
2.1引言及研究动机
2.2数据与方法
2.3结果与分析
2.4讨论与小结
3二穗短柄草NBS-LRR抗病基因家族的表达谱分析
3.1引言及研究动机
3.2基因表达谱分析的常用技术
3.3实验数据的获取
3.4结果与分析
3.5讨论与小结
4NBS-LRR基因家族预测算法的设计与应用
4.1研究背景
4.2方法与数据集
4.3结果与分析
5总结与展望
5.1主要研究结果
5.2创新点
5.3展望
附录
附录1缩略词简表
附录2NBS-LRR抗病基因列表
附录3二穗短柄草中我们鉴定出的126个典型的NBS-LRR抗病基因的蛋白序列
附录4NBS-LRR抗病基因的基因簇分布
附录5氨基酸的部分理化性质简表
附录6拟南芥中的正负样本序列列表
附录7NBS-LRR抗病基因的蛋白序列结构域特征
参考文献

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